Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SlkO54988 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SlkO54988 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SlkO54988 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SlkO54988 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SlkO54988 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms