Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sema6bO54951 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms