Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Dnajb6O54946 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Dnajb6O54946 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Dnajb6O54946 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Dnajb6O54946 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Dnajb6O54946 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Dnajb6O54946 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnajb6O54946 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Dnajb6O54946 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms