Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrxO54751 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrxO54751 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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