Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sdc4O35988 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sdc4O35988 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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