Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek2O35942 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nek2O35942 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek2O35942 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek2O35942 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek2O35942 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek2O35942 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek2O35942 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms