Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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Timm44O35857 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Timm44O35857 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Timm44O35857 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Timm44O35857 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Timm44O35857 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Timm44O35857 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Timm44O35857 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Timm44O35857 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms