Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Klf9O35739 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms