Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms