Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc1a6O35544 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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