Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk2O35491 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms