Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Slc27a2O35488 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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