Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Edil3O35474 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms