Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2-ObO35424 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2-ObO35424 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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