Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Abcc1O35379 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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Abcc1O35379 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Abcc1O35379 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcc1O35379 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Abcc1O35379 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Abcc1O35379 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Abcc1O35379 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Abcc1O35379 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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