Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Bhlhe40O35185 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Bhlhe40O35185 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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