Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Nedd9O35177 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nedd9O35177 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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