Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alx4O35137 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Alx4O35137 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Alx4O35137 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Alx4O35137 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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