Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn4O35054 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn4O35054 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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