Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap23O09044 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snap23O09044 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms