Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klf6O08584 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf6O08584 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf6O08584 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf6O08584 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf6O08584 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Klf6O08584 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf6O08584 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf6O08584 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf6O08584 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms