Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20939L7N243 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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