Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm2888K7N746 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm2888K7N746 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2888K7N746 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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