Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3542K7N6U2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3542K7N6U2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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