Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm379J3QQ19 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Gm379J3QQ19 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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