Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm20795J3QP49 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm20795J3QP49 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm20795J3QP49 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm20795J3QP49 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm20795J3QP49 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20795J3QP49 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20795J3QP49 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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