Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm6408J3QNG1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6408J3QNG1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6408J3QNG1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6408J3QNG1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6408J3QNG1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6408J3QNG1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6408J3QNG1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm6408J3QNG1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6408J3QNG1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6408J3QNG1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6408J3QNG1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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