Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pcf11G3X9Z4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcf11G3X9Z4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcf11G3X9Z4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcf11G3X9Z4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcf11G3X9Z4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms