Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp9yF8VPU6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9yF8VPU6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms