Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Farp1F8VPU2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Farp1F8VPU2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms