Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arid4aF8VPQ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms