Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5160F8VPN3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms