Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms