Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm8005F6YKY3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm8005F6YKY3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm8005F6YKY3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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