Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm5218F6YH22 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm5218F6YH22 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms