Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmod3E9QA62 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod3E9QA62 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms