Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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