Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef5E9Q7D5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms