Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm17727E9Q4V7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm17727E9Q4V7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm17727E9Q4V7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm17727E9Q4V7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm17727E9Q4V7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm17727E9Q4V7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm17727E9Q4V7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm17727E9Q4V7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm17727E9Q4V7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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