Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ccdc71lE9Q4T4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc71lE9Q4T4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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