Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cep350E9Q309 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep350E9Q309 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms