Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pdzd2E9Q1M1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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