Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Zfp558E9Q1J0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zfp558E9Q1J0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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