Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms