Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3095E9Q058 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms