Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20425E9Q035 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms