Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gcom1E9PZ54 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gcom1E9PZ54 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms