Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Srp54bE9PXC0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp54bE9PXC0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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