Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc8E9PWG2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms