Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Ttc17E9PVB5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms